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Pymol开源版安装 新版 3.0 / 3.1 Windows安装Pymol开源版

2024年08月02日 Windows 我要评论
PyMOL 是一个开源的分子可视化系统,被广泛应用于结构生物学中。它允许用户可视化分子结构,并创建高质量的蛋白质、核酸和其他大分子的3D图像。多年来,PyMOL不断发展,新版本引入了更多的功能和改进。
pymol 简介

pymol 是一个开源的分子可视化系统,被广泛应用于结构生物学中。它允许用户可视化分子结构,并创建高质量的蛋白质、核酸和其他大分子的3d图像。多年来,pymol不断发展,新版本引入了更多的功能和改进。

pymol 3.0 / 3.1 的安装

安装 pymol 3.0 或 3.1 非常简单,可以在 windows、macos 和 linux 等各种操作系统上进行。以下是最新版本 pymol 的安装步骤。

在 windows 上安装 pymol 3.0 / 3.1
  1. 下载安装程序: 访问 pymol 网站 并下载 windows 安装程序。
  2. 运行安装程序: 双击下载的文件,按照安装向导进行操作。
  3. 完成安装: 安装完成后,可以从开始菜单或桌面快捷方式启动 pymol。

这种版本是需要安装许可证的,因此不算开源版。

在 macos 上安装 pymol 3.0 / 3.1
  1. 下载安装程序: 访问 pymol 网站 并下载 macos 安装程序。
  2. 打开安装程序: 双击下载的 .dmg 文件,将 pymol 拖动到应用程序文件夹。
  3. 启动 pymol: 打开应用程序文件夹,双击 pymol 启动应用程序。

这种版本是需要安装许可证的,因此不算开源版。

解法:通过其他方式去安装开源的版本,windows安装开源的版本可以通过minconda来进行,但是mac并不适用。


pymol 2.6 与 pymol 3.1 的对比

1. 用户界面和可用性:

  • pymol 2.6: 界面功能强大,但设计较旧,对于新用户可能不太直观。
  • pymol 3.1: 这一版本引入了更为精致和用户友好的界面,提升了可用性,使用户更容易导航和执行任务。

2. 性能提升:

  • pymol 2.6: 性能稳定,能够满足大多数分子可视化任务的需求。
  • pymol 3.1: 在渲染速度和整体性能方面有显著提升,特别是在处理大型分子结构时。

3. 新功能:

  • pymol 2.6: 基本的分子可视化功能,支持插件和脚本。
  • pymol 3.1: 引入了新的可视化技术,更好地支持现代图形硬件,增强了脚本功能。

4. 支持和更新:

  • pymol 2.6: 作为旧版本,支持和更新有限。
  • pymol 3.1: 活跃的支持和频繁的更新,确保与最新的操作系统和硬件兼容。

结论

安装好后如下:

从 pymol 2.6 升级到 pymol 3.1 带来了许多改进,包括更好的性能、更直观的界面和新功能,提升了分子可视化体验。pymol 3.0 / 3.1 的安装过程在不同操作系统上都很简单,使其在科学社区中得到广泛应用。如果您仍在使用旧版本,强烈建议升级以利用这些增强功能。

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